As estratégias para a conservação de espécies ameaçadas de extinção são muito diversificadas.

Os zoológicos participam de projetos em cooperação com universidades, centros de pesquisa e ONGs.

Um dos mais característicos programas, são aqueles denominados "Planos de Manejo Reprodutivo e Conservacionista de Espécies Ameaçadas de Extinção".

Os principais objetivos de tais planos são a manutenção da diversidade biológica, a manutenção de populações cativas autosustentáveis e que sejam genéticamente saudáveis, reservatório genético e programas de reintrodução.

No Brasil existem 7 Planos de Manejo, sendo eles:

• Ararajuba Aratinga guarouba

• Arara azul Anadohyncus hyacinthinus

• Ariranha Pteronura brasiliensis

• Canídeos

• Cervídeos

• Felinos

• Jacaré de Papo Amarelo Caiman latirostris

O zoológico de Sorocaba, participa ativamente de todos eles, seja seguindo as recomendações dos cômites de Manejo, seja desenvolvendo pesquisas institucionais e coordenando o Grupo de Trabalho de Canídeos anteriormente denominado Plano de Manejo do Lobo Guará.